一、工作背景
根據《食品安全法》及其實施條例有關規定，原衛生部先后于2010年、2011年發布了《可用于食品的菌種名單》（含21個菌種）、《可用于嬰幼兒食品的菌種名單》（含4個菌種的6個菌株）。2013年《新食品原料安全性審查管理辦法》施行后，又陸續審批公告了16個可用于食品的菌種和8個可用于嬰幼兒食品的菌株。隨著生物科技的發展，近年來，有關國際權威組織對涉及2個名單中部分菌種和菌株的分類學地位和拉丁名稱進行了調整，并在相關國際食品和貿易領域廣泛使用。為規范兩個名單的管理，順應國際食品貿易需要，便于公眾檢索查詢，國家衛生健康委委托國家食品安全風險評估中心對上述2個名單進行更新完善。
二、需要說明的主要問題
（一）更新原則。一是對兩個名單進行增補完善。將原《可用于食品的菌種名單》和《可用于嬰幼兒食品的菌種名單》公布之后，又陸續批準公告的16個可用于食品的菌種和8個可用于嬰幼兒食品的菌株增補進名單。二是調整菌種菌株名稱。某些微生物的分類學地位已經基于全基因組測序結果發生了改變，國際上也做了相應的調整。本次對已經修改名稱的菌，基于菌拉丁文名稱的原始詞根、結合國際上對該詞根的注解進行中文翻譯，并盡量與已有菌的拉丁文中詞根相同部分的中文翻譯保持一致。三是更新《可用于食品的菌種名單》的菌種具體到亞種。鑒于菌種的安全性和有效性具有株的特異性，為了確保食用安全，對于國際科技界將菌分類到亞種，或根據新的分類學規則變為亞種的菌種，名單中的表述具體到亞種（其中動物雙歧桿菌<乳雙歧桿菌>重新劃分為2個亞種）。
（二）新舊菌種名單的銜接。菌種名稱的更新既是科學問題，也涉及產業的平穩發展。在長期的生產經營過程中，產業在市場流通的產品均使用原2個名單的菌種名稱（包括中文名稱和拉丁名稱），消費者已形成普遍認知。名單更新后，政策宣貫解讀、企業調整標簽標識、原產品庫存消化等需要一定過程。為了確保管理科學穩定、不影響正常生產經營，設置了2年的過渡期。并在更新的名單中保留了原名單的中文名稱和拉丁名稱，便于菌種使用者和管理者查閱。過渡期內新舊菌種名稱均可以使用，過渡期滿后均需使用更新后的菌種名單。
（三）更新內容的參考依據。本次名單更新主要依據是國際科技界基于全基因組測序技術在微生物分類學中應用的最新研究成果。在具體菌種的歸屬和表述上也參考了歐洲食品安全局（EFSA）、國際乳品聯合會（IDF）等國際組織和加拿大、丹麥等相關國家對擬更新菌種名單的分類和管理，更新后的名單有較好的國際法規銜接和一致性，便于產業發展。
三、更新的具體內容
（一）?在《可用于食品的菌種名單》和《可用于嬰幼兒食品的菌種名單》中動物雙歧桿菌（Bifidobacterium animalis）增加動物雙歧桿菌動物亞種(Bifidobacterium animalis?subsp.?animalis)，乳雙歧桿菌(Bifidobacterium lactis)更名為動物雙歧桿菌乳亞種(Bifidobacterium animalis?subsp.?lactis)；長雙歧桿菌(Bifidobacterium longum?)更名為長雙歧桿菌長亞種(Bifidobacterium longum?subsp.?longum)，嬰兒雙歧桿菌(Bifidobacterium infantis?)更名為長雙歧桿菌嬰兒亞種(Bifidobacterium longum?subsp.?infantis)，德氏乳桿菌保加利亞亞種（保加利亞乳桿菌）（Lactobacillus delbrueckii?subsp. bulgaricus）更名為德氏乳桿菌保加利亞亞種（Lactobacillus delbrueckii?subsp. bulgaricus），嗜熱鏈球菌（Streptococcus thermophilus）更名為唾液鏈球菌嗜熱亞種（Streptococcus salivarius?subsp.?thermophilus），乳酸乳球菌乳酸亞種（Lactococcus lactis?subsp. lactis）更名為乳酸乳球菌乳亞種（Lactococcus lactis?subsp. lactis），乳酸乳球菌雙乙酰亞種（Lactococcus lactis?subsp. diacetylactis）更名為乳酸乳球菌乳亞種（雙乙酰型）（Lactococcus lactis?subsp. lactis?biovar diacetylactis），乳酸乳球菌乳脂亞種（Lactococcus lactis?subsp.?cremoris）更名為乳脂乳球菌（Lactococcus cremoris）。
（二）根據國際有關菌種分類地位的變化情況，《可用于食品的菌種名單》及《可用于嬰幼兒食品的菌種名單》中12個菌種更新為不同種屬。
1.干酪乳桿菌（Lactobacillus casei）、副干酪乳桿菌（Lactobacillus paracasei）和鼠李糖乳桿菌（Lactobacillus rhamnosus）分別更名為干酪乳酪桿菌（Lacticaseibacillus?casei）、副干酪乳酪桿菌（Lacticaseibacillus?paracasei）和鼠李糖乳酪桿菌（Lacticaseibacillus rhamnosus）；
2.發酵乳桿菌（Lactobacillus fermentum）和羅伊氏乳桿菌（Lactobacillus reuteri）分別更名為發酵粘液乳桿菌（Limosilactobacillus fermentum）和羅伊氏粘液乳桿菌(Limosilactobacillus reuteri)；
3.植物乳桿菌（Lactobacillus plantarum）更名為植物乳植桿菌（Lactiplantibacillus plantarum）;
4.唾液乳桿菌（Lactobacillus salivarius）更名為唾液聯合乳桿菌（Ligilactobacillus salivarius）;
5.彎曲乳桿菌（Lactobacillus curvatus）和清酒乳桿菌（Lactobacillus sakei）分別更名為彎曲廣布乳桿菌（Latilactobacillus curvatus）和清酒廣布乳桿菌（Latilactobacillus sakei）；
6.產丙酸丙酸桿菌（Propionibacterium acidipropionici）更名為產丙酸丙酸菌?（Acidipropionibacterium acidipropionici）；
7.凝結芽孢桿菌（Bacillus coagulans）更名為凝結魏茨曼氏菌（Weizmannia coagulans）；
8.小牛葡萄球菌?（Staphylococcus vitulinus）更名為小牛動物球菌（Mammaliicoccus vitulinus）。
相關鏈接：國家衛健委關于《可用于食品的菌種名單》和《可用于嬰幼兒食品的菌種名單》更新的公告